Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5P9

Ighv5-4, Immunoglobulin heavy variable 5-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-4A0A075B5P9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ighv5-4A0A075B5P9 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms