Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms