Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Crlf3Q9Z2L7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crlf3Q9Z2L7 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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