Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Pdpk1Q9Z2A0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdpk1Q9Z2A0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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