Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms