Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lgr5Q9Z1P4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lgr5Q9Z1P4 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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