Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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