Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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