Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf6Q9DBU5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf6Q9DBU5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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