Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl17Q9D8P4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl17Q9D8P4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms