Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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