Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms