Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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