Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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