Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms