Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp1b4Q99ME6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp1b4Q99ME6 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms