Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prpf19Q99KP6 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms