Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pacsin3Q99JB8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pacsin3Q99JB8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pacsin3Q99JB8 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pacsin3Q99JB8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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