Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf144aQ925F3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Rnf144aQ925F3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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