Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hecw1Q8K4P8 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hecw1Q8K4P8 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hecw1Q8K4P8 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hecw1Q8K4P8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Hecw1Q8K4P8 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Hecw1Q8K4P8 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms