Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot6Q8K3P5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms