Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Brf1Q8CFK2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Brf1Q8CFK2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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