Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Usp27Q8CEG8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp27Q8CEG8 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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