Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Nhlrc3Q8CCH2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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