Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms