Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms