Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Ssc5dQ8BV57 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssc5dQ8BV57 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Ssc5dQ8BV57 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Ssc5dQ8BV57 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Ssc5dQ8BV57 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ssc5dQ8BV57 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssc5dQ8BV57 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms