Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ChfrQ810L3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms