Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms