Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms