Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RgmaQ6PCX7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms