Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms