Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ctnna3Q65CL1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ctnna3Q65CL1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ctnna3Q65CL1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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