Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Znrf3Q5SSZ7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms