Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms