Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BB287469Q3UT53 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms