Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms