Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nek10Q3UGM2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms