Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms