Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms