Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Traf3ip1Q149C2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Traf3ip1Q149C2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Traf3ip1Q149C2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms