Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ttc39dQ0VF76 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ttc39dQ0VF76 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms