Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms