Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rbp2Q08652 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rbp2Q08652 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms