Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms