Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm26800-201ENSMUST00000180871 349 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms