Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Uqcc1-204ENSMUST00000109636 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms