Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Otx2P80206 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Otx2P80206 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Otx2P80206 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Otx2P80206 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Otx2P80206 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms