Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxd13P70217 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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