Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gpc4P51655 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms